The world changes, therefore the professionals connected with the design and molecular optimization of drugs also. The large projects as the human genome and the advances in the tecnology of the computers permit us a better analysis toward it called "rational Design of drugs" achieving that the cost and time in investigation they be reduced each day but. Unfortunately these skills are not widely available. This small blog has as an objective to orient you in this new one area
En esta ocasión hago publico… el fin para el cual se fue creando este blog, para ser sincero primero nació la idea a modo de iniciativa o esperanza de hacer conocido este campo al cual me dedico, pero después me di cuenta que a la vez era en cierta forma una buena fuente dar a conocer mi perfil profesional, pero ahora que lo tengo mas claro creo que dedicare mis esfuerzos tratar de ganar fanáticos hacia la Bioinformática, la Química medicinal, la química computacional y demás disciplinas a las cuales me dedico, espero por favor me disculpen si a veces aprovecho para colgar cosas relacionadas a mi. Es por estas razones que a partir de estos momentos habilito la opción de comentarios, espero por favor me puedan dar sus opiniones sobre que puntos les gustaría se toquen.
Las líneas a tratar serán: Diseño racional de drogas y todas las herramientas que implica. Bioinformática estructural. Química medicinal. Química computacional. Chemoinformatics.
Los videos que muestro a continuación no hacen mas que recordarnos quienes somos; es decir como se origino todo, y como se intenta llevar a cabo la misma tarea, claro esta sin perder la esencia principal… ser intuitivos. El primer video es sobre la síntesis organica netamente experimental y el segundo video sobre el diseño racional in silico desarrollado actualmente.
English
In this occasion I cause I publish… the end for which went creating this blog, to be sincere first was born the idea by way of initiative or hope of doing acquaintance this field to which I dedicate me, but later I realized that at the same time was in certain form a good source to bring to light my professional profile, but now that I have him but clearly I believe that I dedicated my efforts Trying to win fanatics toward the Bioinformatics, medicinal Chemistry, computational chemistry and other disciplines to which I dedicate me, I expect please they excuse me if at times I take advantage of to hang things related to my. It is for these reasons that from these moments I supply the option of comments, I expect please their opinions can give i on that points them would like they be touched. The lines to treat will be: Rational design of drugs and all the tools that implies. Bioinformática structural. Medicinal chemistry. Computational chemistry. Chemoinformatics. The videos that show subsequently do not do but that to recall us who we are; that is to say as I am originated all, and like tries to carry out the same task, clear this without losing the main essence… to be intuitive. The first video is on the synthesis organic clearly experimental and the second video on the rational design in silico developed at present..
Como tenia que ser..!!! Un reencuentro con mi alma Mater..!! La UNMSM. Si señores, hasta que por fin acabo…!! Jejeje naaa es broma, este fue el segundo curso en el que participe, junto a mi profesor Mirko y mis amigos Andrés y Antonio. Una vez mas una experiencia enriquecedora, y sobre todo un poco de estrés como deporte al tener que planear la practica y demás, un descanso por fin… al menos de mas de un mes, es lo que espera. Gracias a Sociedad Científica de Genética y Biotecnología por la invitación a su curso, en especial a Álvaro por ser el nexo.
English
As had to be. .!!! A reunion with my soul Mater. .!! The UNMSM. Yes sir, until I finally!! Jejeje naaa is joke, this was the second course in which participate, next to my professor Mirko and my friends Andrés and Antonio. Once again a rewarding experience, and above all a little stress as sport upon having that to plan practices it and others, a rest at last… at least of but of a month, is what expects. Thanks to Scientific Society of Genetics and Biotechnology for the invitation to the course, especially as the link Álvaro.
Este es el anuncio de mi primer curso dictado, una experiencia realmente reconfortante pues marca un objetivo cumplido; es decir dictar mi primer curso con 24 primaveras. Debo agradecer a los chicos de la BioUnalm por brindarme esta oportunidad y a mi compañero y amigo Andrés con el que compartí clases.
English.
This it is the announcement of my first dictated course, a really rewarding experience therefore marks a polite objective; that is to say to dictate my first course with 24 springs. I should thank the boys of the BioUnalm by offering me this opportunity and to my companion and friend Andrés with the one that I shared classes.
El diseño asistido por computador remoto (o computadora u ordenador), abreviado como DAO (Diseño Asistido por Ordenador) pero más conocido por sus siglas inglesas CAD (Computer Aided Design), es el uso de un amplio rango de herramientas computacionales que asisten a ingenieros, arquitectos y a otros profesionales del diseño en sus respectivas actividades. También se llega a encontrar denotado con una adicional "Dc=0" en las siglas CADD, diseño y bosquejo asistido por computadora (Computer Aided Drafting and Design).
Quízas Ustedes han oído durante los últimos años palabras y conceptos nuevos en la rama química-farmacéutica, que no son muy familiares, por su origen casi únicamente en inglés, como p.ej. Combinatorial Chemistry, Building Block Libraries, Computational Chemistry, Computer-assisted drug design (CADD), QSAR, High Throughput Screening (HTS), etc., que significan: Química Combinatoria, Bibliotecas de Unidades de Ensamblaje, Química Computacional, Diseño de Fármacos asistido por Computadora, Relación Cuantitativa entre Estructura y Actividad, Rastreo de Proceso de Alto Rendimiento.
Detrás de estas palabras se esconde una verdadera revolución en la estrategia de la síntesis y evaluación para obtener nuevos fármacos. El motor detrás de estos cambios radicales es la presión económica: hasta la mitad de esta década, el costo por fármaco activo encontrado, aumentó exponencialmente llegando a sólo 4 activos por cada 1000 empleados y año, con un tiempo de hasta 15 años entre descubrimiento y posición en el mercado. Las nuevas técnicas prometen según estimaciones, 14 nuevos activos por 1000 empleados/año, acortándose el tiempo hasta el lanzamiento a 8-10 años, con el decrecimiento (se espera un factor 10) correspondiente en el costo del desarrollo de un nuevo fármaco, que hoy en día es, con más de 360 millones Dólares por cada nuevo activo comercializado, lo que es demasiado alto. La mayoría de los avances descritos 'nacieron' en el ámbito de la Biotecnología e Ingeniería Genética. La presente exposición no enfoca esta parte, sino más bien sus avances para el desarrollo de fármacos nuevos "clásicos".
En este video podemos apreciar el uso de las diferentes herramientas que provee el modelamiento molecular: docking (interaccion ligando-receptor), dinamica molecular (predecir la estabilidad del complejo), optimizacion geometrica (estructura mas estable).
A continuación presento una definición muy conocida y muy accesible por cierto (fuente: Wikipedia). El Modelado molecular es un término general que engloba métodos teóricos y técnicas computacionales para modelar o imitar el comportamiento de moléculas. Las técnicas son utilizadas en los campos de la Química computacional, Biología computacional y Ciencia de materiales para el estudio de sistemas moleculares que abarcan desde pequeños sistemas químicos a grandes moléculas biológicas y disposiciones materiales. Los cálculos más simples pueden ser realizados a mano, pero inevitablemente se requieren computadoras para realizar el modelado molecular de cualquier sistema medianamente complicado.
Como ustedes podrán notar se hace mención a diferentes campos o disciplinas, seria bueno que le den una ojeada a los diferentes links.
XVII Congreso Científico Peruano de Estudiantes de Farmacia y Bioquímica
“I+D farmaceutico en el Perú: Propuesta de una metodología para el diseño y optimización molecular de farmacos utilizando métodos computacionales y bioinformáticos.”
XVI Congreso Científico Peruano de Estudiantes de Farmacia y Bioquímica
“Efecto antibacteriano “in Vitro” del enjuague bucal a base del aceite esencial de Minthostachys mollis (Muña) frente a Streptococcus mutans.”
“Actividad del extracto hidroalcoholico del pericarpo del fruto de Anacardium occidentale L. (Marañon), en onicomicosis y forma de dosificación”
*Profesor Invitado a dictar clases practicas de “Introducción a la Bioinformática” en el curso de Biología Molecular. De Octubre a Noviembre del 2007
Escuelas Profesionales de Biotecnología, Microbiología y Genética. Facultad de Ciencias Biológicas. Universidad Nacional Mayor de San Marcos
*Profesor invitado a dictar clases teóricas y practicas de “Uso de herramientas computacionales y Bioinformáticas en el diseño de fármacos” en el la cátedra de Química Farmacéutica. De Marzo a Abril del 2008
*Profesor invitado a dictar clases teóricas de “Introduccion a estudios SAR y QSAR” en el modulo tecnológico del curso de titulacion. Agosto del 2008
Escuela Profesional de Farmacia y Bioquímica. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Universidad Nacional Mayor de San Marcos.
Subvención economica, otorgada por la "Fundacion Hipolito unanue",
"Estudio de Docking y Dinámica Molecular entre Azul de Metileno y Glutation Reductasa de Plasmodium falciparum y su Potencial Aplicación al Diseño de Fármacos Antimaláricos"
Bach. Miguel Quiliano, Dr. Mirko Zimic, MSc. MHS. PhD.,
Universidad Peruana Cayetano Heredia, Fac. de Ciencias y Filosofía.
Graduate of the Faculty of Pharmacy and Biochemistry at Universidad Nacional Mayor de San Marcos (UNMSM, 2002-2007). Motivated by biological and chemistry topics involved in the drug development, since the third year of studies was part of the Farmacognosy and Traditional Medicine laboratory in which collaborated as a research assistant. In the last years of studies, the “rational” design and molecular optimization of new drugs kept his attention, the genome project and the new tools implemented in computational devices helped in this new “objective”. As a consequence, he decided to carry out his pre-professional practices at Universidad Cayetano Heredia (UPCH), specifically at Bioinformatics and Biology molecular Unit. During his firsts and last years in the laboratory, he focused in the study of infectious diseases using new disciplines and tools such structural bioinformatics, chemoinformatics, etc. Among the computational tools that he utilizes highlight Autodock, Gaussian03, among others. Nowadays, he is exploring the “wet lab” world, in an attempt to corroborate the theoretical at Universidad de Navarra (UNAV), Unidad de I+D de medicamentos.